Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GNPDA1P46926 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNPDA1P46926 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms