Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A2P43004 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A2P43004 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A2P43004 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms