Protein–RNA interactions for Protein: P40227

CCT6A, T-complex protein 1 subunit zeta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT6AP40227 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT6AP40227 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCT6AP40227 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT6AP40227 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT6AP40227 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms