Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPA9P38646 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPA9P38646 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA9P38646 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms