Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGCXP38435 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGCXP38435 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGCXP38435 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGCXP38435 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGCXP38435 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGCXP38435 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GGCXP38435 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGCXP38435 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGCXP38435 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GGCXP38435 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGCXP38435 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GGCXP38435 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGCXP38435 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGCXP38435 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGCXP38435 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGCXP38435 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGCXP38435 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGCXP38435 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGCXP38435 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GGCXP38435 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GGCXP38435 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGCXP38435 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGCXP38435 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGCXP38435 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGCXP38435 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGCXP38435 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGCXP38435 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGCXP38435 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GGCXP38435 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GGCXP38435 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GGCXP38435 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGCXP38435 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGCXP38435 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGCXP38435 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGCXP38435 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGCXP38435 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGCXP38435 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGCXP38435 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGCXP38435 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGCXP38435 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGCXP38435 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGCXP38435 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGCXP38435 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGCXP38435 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGCXP38435 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGCXP38435 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGCXP38435 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GGCXP38435 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
GGCXP38435 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGCXP38435 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGCXP38435 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGCXP38435 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGCXP38435 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGCXP38435 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GGCXP38435 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGCXP38435 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGCXP38435 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGCXP38435 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGCXP38435 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGCXP38435 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGCXP38435 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGCXP38435 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGCXP38435 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGCXP38435 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGCXP38435 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGCXP38435 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGCXP38435 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGCXP38435 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGCXP38435 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGCXP38435 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGCXP38435 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGCXP38435 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGCXP38435 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGCXP38435 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGCXP38435 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGCXP38435 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGCXP38435 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGCXP38435 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GGCXP38435 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGCXP38435 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGCXP38435 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGCXP38435 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGCXP38435 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms