Protein–RNA interactions for Protein: P37173

TGFBR2, TGF-beta receptor type-2, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR2P37173 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGFBR2P37173 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR2P37173 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR2P37173 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms