Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RORAP35398 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RORAP35398 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RORAP35398 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RORAP35398 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RORAP35398 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RORAP35398 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RORAP35398 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RORAP35398 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RORAP35398 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RORAP35398 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RORAP35398 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RORAP35398 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RORAP35398 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RORAP35398 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORAP35398 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORAP35398 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORAP35398 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORAP35398 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORAP35398 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RORAP35398 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RORAP35398 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RORAP35398 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RORAP35398 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RORAP35398 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RORAP35398 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RORAP35398 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RORAP35398 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RORAP35398 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RORAP35398 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RORAP35398 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RORAP35398 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORAP35398 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORAP35398 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORAP35398 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORAP35398 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RORAP35398 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORAP35398 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORAP35398 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORAP35398 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RORAP35398 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RORAP35398 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RORAP35398 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RORAP35398 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RORAP35398 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RORAP35398 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RORAP35398 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RORAP35398 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RORAP35398 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RORAP35398 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RORAP35398 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RORAP35398 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RORAP35398 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RORAP35398 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RORAP35398 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RORAP35398 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RORAP35398 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RORAP35398 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RORAP35398 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RORAP35398 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RORAP35398 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RORAP35398 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RORAP35398 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RORAP35398 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RORAP35398 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORAP35398 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORAP35398 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORAP35398 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RORAP35398 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORAP35398 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORAP35398 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORAP35398 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORAP35398 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORAP35398 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RORAP35398 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RORAP35398 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RORAP35398 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RORAP35398 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RORAP35398 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RORAP35398 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RORAP35398 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RORAP35398 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RORAP35398 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RORAP35398 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RORAP35398 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RORAP35398 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RORAP35398 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RORAP35398 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RORAP35398 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RORAP35398 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RORAP35398 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RORAP35398 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RORAP35398 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORAP35398 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORAP35398 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORAP35398 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORAP35398 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORAP35398 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORAP35398 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORAP35398 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms