Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA11P31270 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HOXA11P31270 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA11P31270 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA11P31270 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXA11P31270 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA11P31270 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA11P31270 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA11P31270 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA11P31270 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA11P31270 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms