Protein–RNA interactions for Protein: P30153

PPP2R1A, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R1AP30153 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPP2R1AP30153 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPP2R1AP30153 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPP2R1AP30153 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPP2R1AP30153 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PPP2R1AP30153 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPP2R1AP30153 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPP2R1AP30153 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PPP2R1AP30153 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPP2R1AP30153 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPP2R1AP30153 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPP2R1AP30153 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPP2R1AP30153 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PPP2R1AP30153 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms