Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1BP28222 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR1BP28222 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTR1BP28222 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR1BP28222 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms