Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHMLP26374 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHMLP26374 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHMLP26374 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHMLP26374 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHMLP26374 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHMLP26374 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHMLP26374 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHMLP26374 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHMLP26374 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHMLP26374 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHMLP26374 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHMLP26374 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHMLP26374 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHMLP26374 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHMLP26374 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHMLP26374 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHMLP26374 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHMLP26374 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHMLP26374 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHMLP26374 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CHMLP26374 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHMLP26374 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHMLP26374 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHMLP26374 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHMLP26374 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHMLP26374 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHMLP26374 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHMLP26374 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHMLP26374 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHMLP26374 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHMLP26374 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHMLP26374 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHMLP26374 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHMLP26374 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHMLP26374 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHMLP26374 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHMLP26374 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHMLP26374 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHMLP26374 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHMLP26374 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHMLP26374 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CHMLP26374 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHMLP26374 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CHMLP26374 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHMLP26374 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHMLP26374 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHMLP26374 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMLP26374 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMLP26374 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMLP26374 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMLP26374 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHMLP26374 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CHMLP26374 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHMLP26374 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHMLP26374 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHMLP26374 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHMLP26374 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHMLP26374 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CHMLP26374 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHMLP26374 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHMLP26374 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHMLP26374 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHMLP26374 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMLP26374 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMLP26374 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMLP26374 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMLP26374 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMLP26374 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMLP26374 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMLP26374 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHMLP26374 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHMLP26374 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHMLP26374 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHMLP26374 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHMLP26374 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHMLP26374 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CHMLP26374 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHMLP26374 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHMLP26374 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CHMLP26374 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHMLP26374 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHMLP26374 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CHMLP26374 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CHMLP26374 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHMLP26374 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CHMLP26374 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHMLP26374 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHMLP26374 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHMLP26374 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHMLP26374 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHMLP26374 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHMLP26374 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHMLP26374 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHMLP26374 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHMLP26374 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHMLP26374 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHMLP26374 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHMLP26374 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHMLP26374 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms