Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSSP25774 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSSP25774 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSSP25774 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSSP25774 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSSP25774 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSSP25774 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSSP25774 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSSP25774 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSSP25774 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSSP25774 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSSP25774 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSSP25774 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSSP25774 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSSP25774 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSSP25774 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSSP25774 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSSP25774 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSSP25774 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSSP25774 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSSP25774 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSSP25774 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSSP25774 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSSP25774 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSSP25774 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSSP25774 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSSP25774 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSSP25774 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSSP25774 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSSP25774 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSSP25774 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSSP25774 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSSP25774 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSSP25774 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSSP25774 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSSP25774 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSSP25774 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSSP25774 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSSP25774 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSSP25774 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSSP25774 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSSP25774 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSSP25774 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSSP25774 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSSP25774 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSSP25774 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSSP25774 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSSP25774 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSSP25774 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSSP25774 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSSP25774 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSSP25774 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSSP25774 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSSP25774 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSSP25774 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSSP25774 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSSP25774 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSSP25774 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSSP25774 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSSP25774 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSSP25774 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSSP25774 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSSP25774 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSSP25774 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSSP25774 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSSP25774 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSSP25774 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSSP25774 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSSP25774 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSSP25774 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSSP25774 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSSP25774 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSSP25774 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSSP25774 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSSP25774 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSSP25774 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSSP25774 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSSP25774 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSSP25774 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSSP25774 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSSP25774 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSSP25774 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSSP25774 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSSP25774 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSSP25774 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSSP25774 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSSP25774 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSSP25774 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSSP25774 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSSP25774 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSSP25774 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSSP25774 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSSP25774 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSSP25774 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSSP25774 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSSP25774 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSSP25774 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSSP25774 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSSP25774 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms