Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPREP23469 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPREP23469 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPREP23469 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPREP23469 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPREP23469 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPREP23469 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPREP23469 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPREP23469 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPREP23469 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPREP23469 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPREP23469 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPREP23469 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPREP23469 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPREP23469 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPREP23469 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPREP23469 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPREP23469 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPREP23469 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPREP23469 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPREP23469 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPREP23469 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPREP23469 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPREP23469 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPREP23469 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPREP23469 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPREP23469 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPREP23469 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPREP23469 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPREP23469 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPREP23469 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPREP23469 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPREP23469 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPREP23469 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPREP23469 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPREP23469 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPREP23469 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPREP23469 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPREP23469 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPREP23469 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPREP23469 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPREP23469 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPREP23469 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPREP23469 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPREP23469 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPREP23469 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPREP23469 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPREP23469 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPREP23469 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPREP23469 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPREP23469 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPREP23469 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPREP23469 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPREP23469 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPREP23469 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPREP23469 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPREP23469 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPREP23469 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPREP23469 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPREP23469 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPREP23469 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPREP23469 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPREP23469 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPREP23469 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPREP23469 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPREP23469 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPREP23469 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPREP23469 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPREP23469 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPREP23469 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPREP23469 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPREP23469 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPREP23469 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPREP23469 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPREP23469 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPREP23469 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPREP23469 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPREP23469 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPREP23469 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPREP23469 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPREP23469 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPREP23469 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPREP23469 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPREP23469 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPREP23469 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPREP23469 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPREP23469 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPREP23469 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPREP23469 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPREP23469 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPREP23469 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPREP23469 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPREP23469 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPREP23469 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPREP23469 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPREP23469 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPREP23469 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPREP23469 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPREP23469 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPREP23469 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms