Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPS6KB1P23443 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPS6KB1P23443 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPS6KB1P23443 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPS6KB1P23443 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPS6KB1P23443 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPS6KB1P23443 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPS6KB1P23443 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPS6KB1P23443 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPS6KB1P23443 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms