Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PVALBP20472 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PVALBP20472 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PVALBP20472 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PVALBP20472 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PVALBP20472 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PVALBP20472 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PVALBP20472 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PVALBP20472 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PVALBP20472 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PVALBP20472 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PVALBP20472 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PVALBP20472 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PVALBP20472 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PVALBP20472 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PVALBP20472 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PVALBP20472 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PVALBP20472 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PVALBP20472 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PVALBP20472 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PVALBP20472 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PVALBP20472 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PVALBP20472 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PVALBP20472 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PVALBP20472 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PVALBP20472 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PVALBP20472 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PVALBP20472 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PVALBP20472 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PVALBP20472 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PVALBP20472 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PVALBP20472 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PVALBP20472 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PVALBP20472 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PVALBP20472 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PVALBP20472 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PVALBP20472 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PVALBP20472 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PVALBP20472 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PVALBP20472 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PVALBP20472 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PVALBP20472 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PVALBP20472 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PVALBP20472 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PVALBP20472 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PVALBP20472 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PVALBP20472 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PVALBP20472 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PVALBP20472 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PVALBP20472 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PVALBP20472 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PVALBP20472 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PVALBP20472 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PVALBP20472 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PVALBP20472 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PVALBP20472 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PVALBP20472 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PVALBP20472 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PVALBP20472 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PVALBP20472 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PVALBP20472 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PVALBP20472 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PVALBP20472 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PVALBP20472 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PVALBP20472 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PVALBP20472 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PVALBP20472 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PVALBP20472 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PVALBP20472 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PVALBP20472 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PVALBP20472 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PVALBP20472 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PVALBP20472 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PVALBP20472 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PVALBP20472 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PVALBP20472 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PVALBP20472 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PVALBP20472 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PVALBP20472 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PVALBP20472 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PVALBP20472 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PVALBP20472 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PVALBP20472 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PVALBP20472 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PVALBP20472 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PVALBP20472 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PVALBP20472 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PVALBP20472 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PVALBP20472 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PVALBP20472 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PVALBP20472 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PVALBP20472 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PVALBP20472 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PVALBP20472 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PVALBP20472 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PVALBP20472 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PVALBP20472 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PVALBP20472 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PVALBP20472 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PVALBP20472 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms