Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9A1P19634 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC9A1P19634 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC9A1P19634 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms