Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CD53P19397 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD53P19397 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD53P19397 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD53P19397 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD53P19397 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD53P19397 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD53P19397 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD53P19397 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD53P19397 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD53P19397 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD53P19397 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD53P19397 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD53P19397 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD53P19397 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD53P19397 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD53P19397 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD53P19397 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD53P19397 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD53P19397 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD53P19397 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD53P19397 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD53P19397 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD53P19397 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD53P19397 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD53P19397 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD53P19397 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD53P19397 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD53P19397 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD53P19397 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD53P19397 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD53P19397 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD53P19397 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD53P19397 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD53P19397 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD53P19397 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD53P19397 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD53P19397 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD53P19397 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD53P19397 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD53P19397 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD53P19397 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD53P19397 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD53P19397 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD53P19397 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD53P19397 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD53P19397 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD53P19397 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD53P19397 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD53P19397 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD53P19397 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD53P19397 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD53P19397 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD53P19397 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD53P19397 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD53P19397 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD53P19397 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD53P19397 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD53P19397 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD53P19397 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD53P19397 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD53P19397 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD53P19397 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD53P19397 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD53P19397 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD53P19397 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD53P19397 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD53P19397 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD53P19397 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD53P19397 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD53P19397 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD53P19397 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD53P19397 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD53P19397 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD53P19397 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD53P19397 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD53P19397 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD53P19397 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD53P19397 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD53P19397 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD53P19397 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD53P19397 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD53P19397 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD53P19397 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD53P19397 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD53P19397 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD53P19397 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD53P19397 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD53P19397 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD53P19397 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD53P19397 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD53P19397 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD53P19397 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD53P19397 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD53P19397 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD53P19397 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD53P19397 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD53P19397 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD53P19397 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD53P19397 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms