Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PFKLP17858 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PFKLP17858 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PFKLP17858 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PFKLP17858 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PFKLP17858 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PFKLP17858 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PFKLP17858 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKLP17858 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKLP17858 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKLP17858 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKLP17858 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKLP17858 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKLP17858 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKLP17858 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKLP17858 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKLP17858 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKLP17858 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKLP17858 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFKLP17858 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFKLP17858 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKLP17858 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKLP17858 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKLP17858 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKLP17858 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKLP17858 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKLP17858 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKLP17858 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKLP17858 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFKLP17858 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFKLP17858 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PFKLP17858 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKLP17858 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKLP17858 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKLP17858 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKLP17858 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKLP17858 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKLP17858 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKLP17858 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKLP17858 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKLP17858 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKLP17858 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKLP17858 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKLP17858 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKLP17858 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFKLP17858 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFKLP17858 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFKLP17858 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFKLP17858 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFKLP17858 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFKLP17858 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFKLP17858 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFKLP17858 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFKLP17858 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PFKLP17858 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKLP17858 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKLP17858 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKLP17858 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKLP17858 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKLP17858 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKLP17858 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKLP17858 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKLP17858 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFKLP17858 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFKLP17858 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFKLP17858 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFKLP17858 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFKLP17858 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFKLP17858 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFKLP17858 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKLP17858 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKLP17858 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKLP17858 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKLP17858 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKLP17858 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFKLP17858 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFKLP17858 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFKLP17858 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFKLP17858 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFKLP17858 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKLP17858 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKLP17858 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKLP17858 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKLP17858 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKLP17858 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKLP17858 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKLP17858 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKLP17858 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKLP17858 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PFKLP17858 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFKLP17858 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFKLP17858 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PFKLP17858 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKLP17858 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKLP17858 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKLP17858 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKLP17858 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKLP17858 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKLP17858 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKLP17858 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms