Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
UBTFP17480 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
UBTFP17480 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
UBTFP17480 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
UBTFP17480 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
UBTFP17480 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
UBTFP17480 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.7■■■■■ 4.11
UBTFP17480 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
UBTFP17480 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
UBTFP17480 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
UBTFP17480 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
UBTFP17480 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
UBTFP17480 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
UBTFP17480 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
UBTFP17480 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
UBTFP17480 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
UBTFP17480 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
UBTFP17480 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
UBTFP17480 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
UBTFP17480 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
UBTFP17480 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
UBTFP17480 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
UBTFP17480 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
UBTFP17480 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
UBTFP17480 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
UBTFP17480 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
UBTFP17480 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
UBTFP17480 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
UBTFP17480 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
UBTFP17480 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
UBTFP17480 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
UBTFP17480 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
UBTFP17480 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
UBTFP17480 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
UBTFP17480 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
UBTFP17480 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
UBTFP17480 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
UBTFP17480 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
UBTFP17480 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
UBTFP17480 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
UBTFP17480 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
UBTFP17480 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
UBTFP17480 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
UBTFP17480 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
UBTFP17480 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
UBTFP17480 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
UBTFP17480 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
UBTFP17480 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
UBTFP17480 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
UBTFP17480 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
UBTFP17480 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
UBTFP17480 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
UBTFP17480 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.54■■■■■ 4.08
UBTFP17480 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.54■■■■■ 4.08
UBTFP17480 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
UBTFP17480 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
UBTFP17480 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
UBTFP17480 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
UBTFP17480 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
UBTFP17480 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
UBTFP17480 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
UBTFP17480 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
UBTFP17480 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
UBTFP17480 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
UBTFP17480 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
UBTFP17480 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
UBTFP17480 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
UBTFP17480 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
UBTFP17480 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
UBTFP17480 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
UBTFP17480 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
UBTFP17480 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
UBTFP17480 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
UBTFP17480 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
UBTFP17480 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
UBTFP17480 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
UBTFP17480 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
UBTFP17480 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
UBTFP17480 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
UBTFP17480 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
UBTFP17480 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
UBTFP17480 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
UBTFP17480 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
UBTFP17480 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
UBTFP17480 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
UBTFP17480 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
UBTFP17480 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
UBTFP17480 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
UBTFP17480 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
UBTFP17480 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
UBTFP17480 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
UBTFP17480 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
UBTFP17480 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
UBTFP17480 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
UBTFP17480 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
UBTFP17480 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
UBTFP17480 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
UBTFP17480 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC40.34■■■■■ 4.05
UBTFP17480 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
UBTFP17480 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms