Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA1P14867 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA1P14867 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA1P14867 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA1P14867 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms