Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL11A1P12107 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL11A1P12107 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL11A1P12107 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms