Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT3P12035 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT3P12035 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT3P12035 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT3P12035 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT3P12035 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT3P12035 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT3P12035 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT3P12035 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT3P12035 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT3P12035 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT3P12035 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT3P12035 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT3P12035 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT3P12035 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT3P12035 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT3P12035 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT3P12035 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT3P12035 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT3P12035 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT3P12035 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT3P12035 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT3P12035 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT3P12035 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT3P12035 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT3P12035 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT3P12035 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT3P12035 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT3P12035 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT3P12035 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT3P12035 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT3P12035 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT3P12035 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT3P12035 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT3P12035 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT3P12035 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT3P12035 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT3P12035 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT3P12035 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT3P12035 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT3P12035 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT3P12035 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT3P12035 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT3P12035 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT3P12035 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT3P12035 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT3P12035 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT3P12035 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT3P12035 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT3P12035 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT3P12035 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT3P12035 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT3P12035 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT3P12035 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT3P12035 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT3P12035 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT3P12035 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT3P12035 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT3P12035 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT3P12035 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT3P12035 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT3P12035 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT3P12035 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT3P12035 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT3P12035 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT3P12035 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT3P12035 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT3P12035 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT3P12035 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT3P12035 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT3P12035 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT3P12035 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT3P12035 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT3P12035 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT3P12035 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT3P12035 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT3P12035 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT3P12035 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT3P12035 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT3P12035 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT3P12035 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT3P12035 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT3P12035 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT3P12035 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT3P12035 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT3P12035 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT3P12035 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT3P12035 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT3P12035 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT3P12035 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT3P12035 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT3P12035 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT3P12035 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT3P12035 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT3P12035 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT3P12035 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT3P12035 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT3P12035 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT3P12035 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT3P12035 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms