Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C8orf88P0DMB2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf88P0DMB2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C8orf88P0DMB2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms