Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FREM3P0C091 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FREM3P0C091 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FREM3P0C091 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 372.8 ms