Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD63P08962 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD63P08962 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD63P08962 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD63P08962 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD63P08962 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD63P08962 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD63P08962 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD63P08962 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD63P08962 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD63P08962 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD63P08962 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CD63P08962 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD63P08962 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD63P08962 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD63P08962 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD63P08962 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD63P08962 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD63P08962 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD63P08962 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD63P08962 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD63P08962 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD63P08962 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD63P08962 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD63P08962 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD63P08962 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD63P08962 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD63P08962 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD63P08962 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD63P08962 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD63P08962 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD63P08962 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD63P08962 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD63P08962 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD63P08962 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD63P08962 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD63P08962 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD63P08962 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD63P08962 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD63P08962 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD63P08962 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD63P08962 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD63P08962 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD63P08962 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD63P08962 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD63P08962 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD63P08962 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD63P08962 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD63P08962 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD63P08962 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD63P08962 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD63P08962 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD63P08962 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD63P08962 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD63P08962 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD63P08962 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD63P08962 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD63P08962 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD63P08962 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD63P08962 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD63P08962 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD63P08962 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD63P08962 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD63P08962 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD63P08962 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD63P08962 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD63P08962 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD63P08962 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD63P08962 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD63P08962 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD63P08962 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD63P08962 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD63P08962 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD63P08962 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD63P08962 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD63P08962 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD63P08962 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD63P08962 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD63P08962 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD63P08962 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD63P08962 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD63P08962 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD63P08962 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD63P08962 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD63P08962 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD63P08962 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD63P08962 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD63P08962 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD63P08962 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD63P08962 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD63P08962 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD63P08962 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CD63P08962 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CD63P08962 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD63P08962 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD63P08962 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD63P08962 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms