Protein–RNA interactions for Protein: P08294

SOD3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD3P08294 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOD3P08294 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOD3P08294 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOD3P08294 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SOD3P08294 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOD3P08294 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOD3P08294 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOD3P08294 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOD3P08294 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOD3P08294 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOD3P08294 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOD3P08294 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOD3P08294 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOD3P08294 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOD3P08294 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOD3P08294 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOD3P08294 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOD3P08294 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOD3P08294 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOD3P08294 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOD3P08294 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOD3P08294 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOD3P08294 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOD3P08294 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOD3P08294 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOD3P08294 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOD3P08294 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOD3P08294 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOD3P08294 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOD3P08294 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOD3P08294 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOD3P08294 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOD3P08294 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOD3P08294 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOD3P08294 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOD3P08294 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOD3P08294 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOD3P08294 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOD3P08294 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SOD3P08294 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOD3P08294 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOD3P08294 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SOD3P08294 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOD3P08294 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOD3P08294 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOD3P08294 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SOD3P08294 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOD3P08294 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOD3P08294 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOD3P08294 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOD3P08294 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SOD3P08294 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SOD3P08294 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOD3P08294 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOD3P08294 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOD3P08294 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOD3P08294 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOD3P08294 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOD3P08294 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOD3P08294 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOD3P08294 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOD3P08294 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOD3P08294 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOD3P08294 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOD3P08294 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOD3P08294 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOD3P08294 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOD3P08294 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOD3P08294 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOD3P08294 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOD3P08294 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOD3P08294 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOD3P08294 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOD3P08294 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOD3P08294 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOD3P08294 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOD3P08294 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOD3P08294 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOD3P08294 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOD3P08294 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOD3P08294 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOD3P08294 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOD3P08294 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOD3P08294 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOD3P08294 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOD3P08294 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOD3P08294 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOD3P08294 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SOD3P08294 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOD3P08294 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOD3P08294 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOD3P08294 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOD3P08294 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOD3P08294 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOD3P08294 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOD3P08294 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOD3P08294 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOD3P08294 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOD3P08294 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOD3P08294 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms