Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB1P08183 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB1P08183 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB1P08183 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms