Protein–RNA interactions for Protein: P07202

TPO, Thyroid peroxidase, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPOP07202 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPOP07202 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPOP07202 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPOP07202 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPOP07202 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPOP07202 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPOP07202 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPOP07202 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPOP07202 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPOP07202 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPOP07202 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPOP07202 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPOP07202 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPOP07202 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPOP07202 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPOP07202 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPOP07202 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPOP07202 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPOP07202 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPOP07202 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPOP07202 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPOP07202 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPOP07202 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPOP07202 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPOP07202 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPOP07202 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPOP07202 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPOP07202 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPOP07202 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPOP07202 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPOP07202 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPOP07202 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPOP07202 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPOP07202 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TPOP07202 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPOP07202 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPOP07202 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPOP07202 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPOP07202 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPOP07202 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPOP07202 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPOP07202 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPOP07202 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPOP07202 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPOP07202 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPOP07202 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPOP07202 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPOP07202 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPOP07202 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPOP07202 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPOP07202 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPOP07202 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPOP07202 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPOP07202 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPOP07202 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPOP07202 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TPOP07202 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPOP07202 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPOP07202 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPOP07202 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPOP07202 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPOP07202 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPOP07202 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPOP07202 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPOP07202 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPOP07202 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPOP07202 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPOP07202 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPOP07202 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPOP07202 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPOP07202 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPOP07202 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPOP07202 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPOP07202 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPOP07202 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPOP07202 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPOP07202 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPOP07202 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPOP07202 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPOP07202 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPOP07202 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPOP07202 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPOP07202 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPOP07202 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPOP07202 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPOP07202 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPOP07202 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPOP07202 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPOP07202 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPOP07202 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPOP07202 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPOP07202 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPOP07202 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPOP07202 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPOP07202 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPOP07202 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPOP07202 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPOP07202 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TPOP07202 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPOP07202 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms