Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCCBP05166 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCCBP05166 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCCBP05166 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCCBP05166 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCCBP05166 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCCBP05166 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCCBP05166 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCCBP05166 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCCBP05166 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCCBP05166 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCCBP05166 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCCBP05166 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCCBP05166 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCCBP05166 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCCBP05166 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCCBP05166 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCCBP05166 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCCBP05166 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCCBP05166 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCCBP05166 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCCBP05166 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCCBP05166 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCCBP05166 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCCBP05166 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCCBP05166 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCCBP05166 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCCBP05166 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCCBP05166 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCCBP05166 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCCBP05166 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCCBP05166 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCCBP05166 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCCBP05166 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCCBP05166 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCCBP05166 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCCBP05166 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCCBP05166 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCCBP05166 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCCBP05166 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCCBP05166 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCCBP05166 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCCBP05166 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCCBP05166 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCCBP05166 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCCBP05166 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCCBP05166 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCCBP05166 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCCBP05166 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCCBP05166 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCCBP05166 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCCBP05166 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCCBP05166 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCCBP05166 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCCBP05166 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCCBP05166 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCCBP05166 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCCBP05166 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCCBP05166 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCCBP05166 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCBP05166 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCBP05166 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCBP05166 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCBP05166 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCBP05166 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCBP05166 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCBP05166 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCCBP05166 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCBP05166 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCBP05166 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCBP05166 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCBP05166 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCBP05166 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCBP05166 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCBP05166 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCBP05166 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCBP05166 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCBP05166 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCBP05166 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCBP05166 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCBP05166 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCBP05166 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCBP05166 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCCBP05166 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCCBP05166 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCCBP05166 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCCBP05166 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCCBP05166 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCCBP05166 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCCBP05166 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCCBP05166 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCCBP05166 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCCBP05166 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCCBP05166 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCCBP05166 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCCBP05166 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCCBP05166 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCCBP05166 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCCBP05166 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCCBP05166 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms