Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NTRK1P04629 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTRK1P04629 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms