Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYCNP04198 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYCNP04198 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYCNP04198 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MYCNP04198 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYCNP04198 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYCNP04198 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYCNP04198 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYCNP04198 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYCNP04198 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYCNP04198 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYCNP04198 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYCNP04198 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYCNP04198 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYCNP04198 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYCNP04198 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYCNP04198 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYCNP04198 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYCNP04198 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYCNP04198 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYCNP04198 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYCNP04198 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYCNP04198 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYCNP04198 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYCNP04198 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MYCNP04198 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYCNP04198 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MYCNP04198 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYCNP04198 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MYCNP04198 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYCNP04198 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYCNP04198 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MYCNP04198 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYCNP04198 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYCNP04198 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYCNP04198 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYCNP04198 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYCNP04198 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYCNP04198 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYCNP04198 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYCNP04198 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYCNP04198 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYCNP04198 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYCNP04198 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYCNP04198 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYCNP04198 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYCNP04198 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYCNP04198 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYCNP04198 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYCNP04198 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYCNP04198 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYCNP04198 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYCNP04198 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYCNP04198 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYCNP04198 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYCNP04198 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYCNP04198 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYCNP04198 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYCNP04198 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MYCNP04198 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYCNP04198 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYCNP04198 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYCNP04198 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYCNP04198 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYCNP04198 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYCNP04198 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYCNP04198 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MYCNP04198 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MYCNP04198 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYCNP04198 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYCNP04198 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYCNP04198 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYCNP04198 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYCNP04198 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYCNP04198 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYCNP04198 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYCNP04198 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYCNP04198 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYCNP04198 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYCNP04198 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYCNP04198 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYCNP04198 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYCNP04198 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYCNP04198 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYCNP04198 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYCNP04198 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYCNP04198 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYCNP04198 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MYCNP04198 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MYCNP04198 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYCNP04198 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYCNP04198 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYCNP04198 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYCNP04198 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYCNP04198 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYCNP04198 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYCNP04198 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYCNP04198 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MYCNP04198 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYCNP04198 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.7 ms