Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL2A1P02458 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL2A1P02458 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
COL2A1P02458 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL2A1P02458 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms