Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYF2O95926 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYF2O95926 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYF2O95926 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYF2O95926 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYF2O95926 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYF2O95926 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYF2O95926 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYF2O95926 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYF2O95926 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYF2O95926 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYF2O95926 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYF2O95926 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYF2O95926 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYF2O95926 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYF2O95926 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYF2O95926 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYF2O95926 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYF2O95926 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYF2O95926 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYF2O95926 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYF2O95926 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYF2O95926 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYF2O95926 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYF2O95926 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYF2O95926 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYF2O95926 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYF2O95926 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYF2O95926 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYF2O95926 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYF2O95926 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYF2O95926 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYF2O95926 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYF2O95926 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYF2O95926 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYF2O95926 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYF2O95926 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYF2O95926 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYF2O95926 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYF2O95926 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYF2O95926 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYF2O95926 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYF2O95926 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYF2O95926 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYF2O95926 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYF2O95926 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYF2O95926 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYF2O95926 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYF2O95926 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYF2O95926 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYF2O95926 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYF2O95926 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYF2O95926 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYF2O95926 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYF2O95926 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYF2O95926 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYF2O95926 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYF2O95926 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYF2O95926 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYF2O95926 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYF2O95926 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYF2O95926 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYF2O95926 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYF2O95926 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYF2O95926 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYF2O95926 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYF2O95926 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYF2O95926 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYF2O95926 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYF2O95926 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYF2O95926 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYF2O95926 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYF2O95926 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYF2O95926 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYF2O95926 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYF2O95926 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYF2O95926 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYF2O95926 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYF2O95926 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYF2O95926 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYF2O95926 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYF2O95926 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYF2O95926 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYF2O95926 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYF2O95926 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYF2O95926 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYF2O95926 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYF2O95926 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYF2O95926 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYF2O95926 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYF2O95926 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYF2O95926 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYF2O95926 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYF2O95926 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYF2O95926 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYF2O95926 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYF2O95926 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYF2O95926 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYF2O95926 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYF2O95926 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms