Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSPAN13O95857 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN13O95857 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms