Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN9O95484 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN9O95484 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLDN9O95484 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN9O95484 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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