Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAPLNO95428 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAPLNO95428 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPLNO95428 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPLNO95428 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PAPLNO95428 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAPLNO95428 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAPLNO95428 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAPLNO95428 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAPLNO95428 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAPLNO95428 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms