Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABARAPO95166 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABARAPO95166 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms