Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRPM2O94759 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRPM2O94759 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRPM2O94759 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRPM2O94759 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRPM2O94759 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRPM2O94759 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRPM2O94759 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms