Protein–RNA interactions for Protein: O75628

REM1, GTP-binding protein REM 1, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REM1O75628 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REM1O75628 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REM1O75628 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REM1O75628 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REM1O75628 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REM1O75628 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
REM1O75628 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REM1O75628 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
REM1O75628 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
REM1O75628 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
REM1O75628 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REM1O75628 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REM1O75628 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REM1O75628 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REM1O75628 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REM1O75628 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REM1O75628 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REM1O75628 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REM1O75628 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
REM1O75628 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
REM1O75628 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
REM1O75628 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REM1O75628 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REM1O75628 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REM1O75628 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REM1O75628 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REM1O75628 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REM1O75628 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REM1O75628 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REM1O75628 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REM1O75628 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REM1O75628 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REM1O75628 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REM1O75628 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REM1O75628 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REM1O75628 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REM1O75628 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
REM1O75628 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REM1O75628 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REM1O75628 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REM1O75628 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REM1O75628 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REM1O75628 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REM1O75628 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REM1O75628 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
REM1O75628 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REM1O75628 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REM1O75628 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REM1O75628 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REM1O75628 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REM1O75628 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REM1O75628 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
REM1O75628 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REM1O75628 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REM1O75628 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REM1O75628 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REM1O75628 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REM1O75628 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REM1O75628 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REM1O75628 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REM1O75628 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REM1O75628 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REM1O75628 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REM1O75628 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REM1O75628 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REM1O75628 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REM1O75628 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REM1O75628 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REM1O75628 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REM1O75628 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REM1O75628 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REM1O75628 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REM1O75628 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REM1O75628 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REM1O75628 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REM1O75628 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REM1O75628 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REM1O75628 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REM1O75628 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REM1O75628 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REM1O75628 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REM1O75628 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REM1O75628 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REM1O75628 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REM1O75628 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REM1O75628 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REM1O75628 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms