Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPM3O75607 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPM3O75607 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NPM3O75607 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPM3O75607 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPM3O75607 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPM3O75607 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NPM3O75607 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM3O75607 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM3O75607 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM3O75607 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM3O75607 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM3O75607 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM3O75607 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM3O75607 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM3O75607 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM3O75607 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPM3O75607 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NPM3O75607 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPM3O75607 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPM3O75607 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPM3O75607 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPM3O75607 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NPM3O75607 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPM3O75607 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM3O75607 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM3O75607 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM3O75607 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM3O75607 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM3O75607 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPM3O75607 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPM3O75607 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPM3O75607 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NPM3O75607 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NPM3O75607 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPM3O75607 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPM3O75607 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NPM3O75607 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPM3O75607 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPM3O75607 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPM3O75607 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPM3O75607 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPM3O75607 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPM3O75607 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NPM3O75607 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NPM3O75607 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NPM3O75607 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NPM3O75607 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NPM3O75607 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPM3O75607 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPM3O75607 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPM3O75607 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPM3O75607 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NPM3O75607 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NPM3O75607 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPM3O75607 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NPM3O75607 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPM3O75607 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPM3O75607 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPM3O75607 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPM3O75607 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPM3O75607 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPM3O75607 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPM3O75607 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPM3O75607 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPM3O75607 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPM3O75607 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPM3O75607 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NPM3O75607 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NPM3O75607 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPM3O75607 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPM3O75607 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPM3O75607 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPM3O75607 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPM3O75607 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPM3O75607 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPM3O75607 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPM3O75607 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPM3O75607 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPM3O75607 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPM3O75607 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NPM3O75607 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPM3O75607 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPM3O75607 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPM3O75607 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPM3O75607 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPM3O75607 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NPM3O75607 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPM3O75607 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPM3O75607 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPM3O75607 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPM3O75607 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPM3O75607 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPM3O75607 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPM3O75607 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPM3O75607 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPM3O75607 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPM3O75607 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPM3O75607 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPM3O75607 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms