Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCATO75600 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCATO75600 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCATO75600 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCATO75600 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCATO75600 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCATO75600 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCATO75600 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCATO75600 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCATO75600 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCATO75600 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCATO75600 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCATO75600 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCATO75600 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCATO75600 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCATO75600 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCATO75600 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCATO75600 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCATO75600 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCATO75600 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCATO75600 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCATO75600 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCATO75600 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCATO75600 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCATO75600 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCATO75600 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCATO75600 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCATO75600 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCATO75600 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GCATO75600 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCATO75600 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCATO75600 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCATO75600 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCATO75600 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCATO75600 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCATO75600 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCATO75600 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCATO75600 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCATO75600 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCATO75600 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCATO75600 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCATO75600 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCATO75600 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCATO75600 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCATO75600 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCATO75600 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCATO75600 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCATO75600 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCATO75600 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCATO75600 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCATO75600 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCATO75600 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCATO75600 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCATO75600 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCATO75600 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCATO75600 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCATO75600 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCATO75600 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCATO75600 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCATO75600 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCATO75600 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCATO75600 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCATO75600 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCATO75600 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCATO75600 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCATO75600 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCATO75600 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCATO75600 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCATO75600 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCATO75600 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GCATO75600 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCATO75600 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCATO75600 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCATO75600 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GCATO75600 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCATO75600 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCATO75600 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCATO75600 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCATO75600 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCATO75600 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCATO75600 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCATO75600 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCATO75600 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCATO75600 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCATO75600 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCATO75600 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCATO75600 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCATO75600 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms