Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM1AO60341 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM1AO60341 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms