Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFS5O43920 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDUFS5O43920 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NDUFS5O43920 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms