Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC28A2O43868 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC28A2O43868 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC28A2O43868 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms