Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC26A4O43511 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC26A4O43511 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC26A4O43511 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC26A4O43511 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms