Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CBFA2T2O43439 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CBFA2T2O43439 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CBFA2T2O43439 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBFA2T2O43439 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBFA2T2O43439 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms