Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNMO15061 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNMO15061 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNMO15061 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
SYNMO15061 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNMO15061 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNMO15061 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNMO15061 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNMO15061 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNMO15061 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNMO15061 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNMO15061 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNMO15061 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNMO15061 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNMO15061 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNMO15061 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNMO15061 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNMO15061 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNMO15061 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNMO15061 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNMO15061 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNMO15061 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNMO15061 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNMO15061 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNMO15061 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNMO15061 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNMO15061 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNMO15061 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNMO15061 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNMO15061 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNMO15061 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNMO15061 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNMO15061 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNMO15061 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNMO15061 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNMO15061 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNMO15061 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNMO15061 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNMO15061 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNMO15061 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNMO15061 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNMO15061 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNMO15061 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNMO15061 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNMO15061 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNMO15061 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNMO15061 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNMO15061 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNMO15061 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNMO15061 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNMO15061 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNMO15061 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNMO15061 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNMO15061 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNMO15061 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNMO15061 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNMO15061 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNMO15061 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNMO15061 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNMO15061 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNMO15061 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNMO15061 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNMO15061 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNMO15061 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNMO15061 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNMO15061 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNMO15061 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNMO15061 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNMO15061 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNMO15061 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNMO15061 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNMO15061 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNMO15061 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNMO15061 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNMO15061 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNMO15061 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNMO15061 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNMO15061 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNMO15061 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNMO15061 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNMO15061 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNMO15061 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNMO15061 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNMO15061 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNMO15061 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNMO15061 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNMO15061 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNMO15061 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNMO15061 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNMO15061 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYNMO15061 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNMO15061 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNMO15061 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNMO15061 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNMO15061 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNMO15061 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNMO15061 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNMO15061 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNMO15061 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNMO15061 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms