Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GIPC1O14908 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GIPC1O14908 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIPC1O14908 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GIPC1O14908 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms