Protein–RNA interactions for Protein: O14524

NEMP1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1O14524 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMP1O14524 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP1O14524 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP1O14524 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP1O14524 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms