Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF4O00268 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF4O00268 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4O00268 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4O00268 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4O00268 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4O00268 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4O00268 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4O00268 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4O00268 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4O00268 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4O00268 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4O00268 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4O00268 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4O00268 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4O00268 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4O00268 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4O00268 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4O00268 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4O00268 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4O00268 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4O00268 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4O00268 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4O00268 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4O00268 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4O00268 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4O00268 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4O00268 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4O00268 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4O00268 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4O00268 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4O00268 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4O00268 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4O00268 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF4O00268 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF4O00268 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF4O00268 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4O00268 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4O00268 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4O00268 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4O00268 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4O00268 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4O00268 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4O00268 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4O00268 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4O00268 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4O00268 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4O00268 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4O00268 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4O00268 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF4O00268 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4O00268 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4O00268 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4O00268 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4O00268 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4O00268 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4O00268 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4O00268 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF4O00268 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4O00268 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4O00268 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4O00268 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF4O00268 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4O00268 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4O00268 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4O00268 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4O00268 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4O00268 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4O00268 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4O00268 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF4O00268 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF4O00268 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF4O00268 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF4O00268 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF4O00268 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF4O00268 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4O00268 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4O00268 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4O00268 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4O00268 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4O00268 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4O00268 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4O00268 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF4O00268 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4O00268 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4O00268 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4O00268 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF4O00268 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4O00268 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4O00268 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4O00268 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4O00268 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4O00268 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4O00268 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF4O00268 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4O00268 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4O00268 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4O00268 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4O00268 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF4O00268 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms